数据集概述
本数据集为儿童骨关节感染金黄色葡萄球菌的遗传分析数据，包含47例儿童样本的全基因组测序结果、毒力基因评估、系统发育树构建及生物膜形成能力检测数据，涉及皮肤定植、皮肤脓肿、骨关节感染（含 septic arthritis、osteomyelitis 等亚型）三类样本，用于探究金黄色葡萄球菌基因组变异与儿童骨关节感染发病机制的关联。
文件详解
- 文档文件（.docx）
- 文件名称：README.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、方法、结果等核心信息
- 文件名称：Links_to_fastq_files__SPADES_contigs_and_output_from_bacterial_analysis_pipeline.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：包含 fastq 文件、SPADES 组装 contigs 及细菌分析 pipeline 输出结果的链接文档
- 数据文件（.xlsx）
- 文件名称：Final_Staph_Gene_Matrix_-_All_bone_joint_infections_and_controls.tsv.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：所有骨关节感染及对照样本的金黄色葡萄球菌基因矩阵数据
- 文件名称：20220516_-_Biofilm_Data_Master.tsv.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：样本静态生物膜形成能力检测的主数据文件
- 文件名称：Staph_Mutation_Data.tsv.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：金黄色葡萄球菌毒力基因突变数据文件
- 文件名称：Acute_Osteomyelitis_Severity_Scoring.tsv.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：急性骨髓炎严重程度评分数据文件
适用场景
- 儿童感染性疾病发病机制研究: 分析金黄色葡萄球菌基因组变异与儿童骨关节感染的关联性
- 细菌毒力基因功能研究: 探究参与宿主免疫逃避的毒力基因在儿童骨关节感染中的作用
- 生物膜形成机制研究: 结合基因数据与生物膜检测结果，解析金黄色葡萄球菌生物膜形成的遗传基础
- 临床感染亚型差异分析: 对比不同感染亚型（皮肤定植、脓肿、骨关节感染）金黄色葡萄球菌的基因组特征
- 抗菌治疗靶点筛选: 基于毒力基因及突变数据，挖掘儿童骨关节感染的潜在治疗靶点
