数据集概述
本数据集为StarDist与TrackMate结合的示例3流动室数据集,包含StarDist示例训练数据集、测试数据集及通过ZeroCostDL4Mic生成的StarDist模型。数据源自亮场显微镜成像,含配对的亮场图像与手动分割掩码,用于生物医学图像分割任务。
文件详解
- 文件名称:Flow chamber dataset.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内含StarDist示例训练数据集、测试数据集及StarDist模型;训练数据集包含配对的亮场显微镜图像(8位.tif格式)与手动分割掩码(8位或16位.tif格式);图像尺寸为1024x1024像素,像素大小650纳米。
数据来源
ZeroCostDL4Mic(GitHub仓库:https://github.com/HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic)
适用场景
- 生物医学图像分割模型训练: 用于StarDist模型的训练与测试,优化亮场显微镜图像的目标分割精度。
- 显微图像分析流程验证: 验证StarDist与TrackMate结合的图像分析流程在流动室场景中的适用性。
- 手动分割掩码应用研究: 基于手动分割的掩码数据,评估自动分割算法的性能。
- 生物医学成像工具链开发: 为ZeroCostDL4Mic平台的StarDist模块优化提供数据支持。