数据集概述
本数据集围绕棘鱼杂交带的梯度耦合与解耦研究，包含2个受自然选择的基因（Eda、ATP1a1）及5个形态性状的相关数据，涉及遗传位点、形态指标及分析文件，共7个文件，用于探究生态选择对基因流动的影响及梯度特征。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：Vines et al Bonsall Creek Readme.txt、README_for_SNP data.txt、CFit Input file.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：Readme文件说明研究背景与数据说明；CFit Input file.txt包含EDAEXON78等基因的梯度分析输入数据
- 数据文件
- 文件名称：SNP data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：含Plate UPC、Sample Name、Individual Name、EDAEXON78、ATP1A1等15个SNP位点及Excluded?（技术重复排除标记）字段
- 文件名称：Bonsall_Morph_Gen_data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：含site（采样点距海距离）、individual、body.length（体长）、plate.morph（骨板形态）、EDAEXON78、ATP1A1等形态与基因字段
- 分析文件
- 文件名称：Vines et al Bonsall Creek Analysis.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：棘鱼杂交带梯度耦合研究的分析结果表
- 文件名称：Vines et al Evolution R code.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于数据统计与梯度分析的R代码文件
数据来源
论文“Cline coupling and uncoupling in a stickleback hybrid zone”（Evolution 2016）
适用场景
- 进化生物学研究：分析棘鱼杂交带中基因与形态性状的梯度耦合特征
- 生态选择机制探究：研究自然选择对基因位点及形态性状的作用
- 遗传形态关联分析：探究Eda、ATP1a1基因与骨板、游泳性能等形态性状的关联
- 杂交带基因流动研究：分析基因连锁不平衡对基因流动的影响机制
- 进化数据分析方法验证：基于R代码复现梯度耦合研究的统计分析流程
