数据集概述
本数据集为2016年7月采集自斯图尔达伦沼泽(Stordalen Mire)的宏转录组数据,包含27个宏转录组样本的信息、基因水平映射数据及MAG水平映射数据。数据由McGivern等人提供,用于极地生态系统微生物转录活性相关研究。
文件详解
- 文件名称:metaT_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含三类核心数据内容:
- MetaT:27个宏转录组样本的基础信息
- metaT_genes:基因水平的映射数据
- metaT_MAGs:宏基因组组装基因组(MAG)水平的映射数据
数据来源
EMERGE Biology Integration Institute、美国国家科学基金会、瑞典极地研究秘书处、SITES、美国能源部基因组科学计划、DOE联合基因组研究所(JGI)、环境分子科学实验室(EMSL)
适用场景
- 极地沼泽生态系统微生物研究:分析Stordalen Mire微生物群落的转录活性与环境适应性
- 宏转录组数据整合分析:利用基因及MAG水平映射数据开展多组学联合研究
- 微生物功能基因挖掘:基于转录组数据识别极地环境中关键功能基因
- 气候变化下生态响应研究:探究极地湿地微生物对气候变暖的转录组响应机制
- 生物信息学方法验证:作为标准数据集测试宏转录组数据处理与分析流程