数据集概述
本数据集为基于博物馆标本测序的苏拉威西特有松鼠进化史研究数据，包含全线粒体基因组和核超保守元件（UCEs）数据，用于构建系统发育树，探究其适应辐射历史、类群分化时间及核质基因树冲突机制，共含9个文件。
文件详解
- 信息统计文件
- 文件名称：FcC_info.xls
- 文件格式：XLS
- 字段映射介绍：推测包含测序样本信息、基因位点统计等基础数据
- 序列比对文件
- 文件名称：157k_362Loci_align_9plus.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：362个UCE位点的序列比对数据
- 子集压缩文件
- 文件名称：157k_38subsets.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含157k UCE数据的38个子集压缩包
- XML元数据文件
- 文件名称：157kUCEs.xml、Mitogene_Tree_DCSPrior.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：分别为UCE数据元信息、线粒体基因树分析参数配置
- 基因树文件
- 文件名称：28ConpleteGeneTrees.newick
- 文件格式：NEWICK
- 字段映射介绍：28个完整基因树的系统发育结构数据
- 超级矩阵文件
- 文件名称：FcC_supermatrix.fas
- 文件格式：FAS
- 字段映射介绍：多基因联合分析的序列超级矩阵数据
- 系统发育树文件
- 文件名称：ML tree of Mitogenomes plus UCE outgroups.newick、NJst_362LociSpTree.newick
- 文件格式：NEWICK
- 字段映射介绍：分别为线粒体+UCE外类群的最大似然树、362个位点的NJst物种树
适用场景
- 生物地理学研究: 分析苏拉威西特有松鼠的地理分化历史与岛屿地质演化的关联
- 分子系统发育分析: 利用核质基因数据构建系统发育树，探究类群间亲缘关系
- 进化时间估算: 基于分子数据推测松鼠类群的分化时间节点
- 核质基因冲突机制研究: 对比核基因与线粒体基因树的差异，分析生物地理隔离与二次接触事件的影响
- 适应性辐射研究: 探究苏拉威西松鼠适应性辐射的起源与演化过程
