数据集概述
本数据集是Moore等人关于Anastrepha属（双翅目：实蝇科）COI DNA条形码库研究的补充材料，包含DNA序列比对、统计表格、系统发育树文件、分类学信息及R脚本等17个文件，支持该属昆虫的分类鉴定与DNA条形码分析研究。
文件详解
- 序列比对文件（.fas格式，8个）
- 文件示例：S2 File. Anastrepha COI barcode alignment.fas、S6 File. Anastrepha COI for gap calculation.fas等
- 内容：包含Anastrepha属COI基因序列比对结果、用于间隙计算的序列、条形码参考序列等
- 统计表格文件（.xlsx格式，6个）
- 文件示例：S5 Table. Statistics for incorrectly identified.xlsx、S3 Table. Taxon sampling accessions and BOLD records.xlsx等
- 内容：涵盖错误鉴定统计、单种鉴定统计、幼虫与成虫鉴定统计、分类单元采样登录号及BOLD记录、物种组分类等信息
- 代码文件（.r格式，1个）
- 文件名称：S5 File. pairwise_distances_intra_inter.R
- 内容：用于计算种内与种间遗传距离的R脚本
- 系统发育树文件（.tre格式，1个）
- 文件名称：S11 File. Anastrepha COI BS NJ tree.tre
- 内容：基于COI序列构建的Anastrepha属邻接系统发育树（含自举检验）
- 文档文件（.docx格式，1个）
- 文件名称：S1 File. Modifications to or exclusions.docx
- 内容：记录序列修改或排除的相关说明
数据来源
Moore et al.论文“A COI DNA Barcode Library for Anastrepha Schiner (Diptera: Tephritidae)”
适用场景
- 昆虫分类学研究：用于Anastrepha属物种的分子鉴定与分类单元划分
- DNA条形码技术应用：验证COI基因作为该属昆虫条形码的有效性与准确性
- 遗传多样性分析：通过种内种间遗传距离计算，研究物种遗传分化程度
- 系统发育关系构建：基于COI序列树文件分析Anastrepha属的亲缘关系
- 生物入侵监测：利用条形码库支持实蝇类害虫的快速鉴定与检疫防控
- 分子生态学研究：结合分类信息与序列数据，探究物种分布与演化规律
