Supplementary_data_for_Harada_细胞器定位A家族DNA聚合酶进化研究补充数据20231129

数据集概述

本数据集是论文“Encyclopaedia of family A DNA polymerases localized in organelles: Evolutionary contribution of bacteria including the proto-mitochondrion”的补充数据,包含134条来自不同真核生物的A家族DNA聚合酶序列及其进化分析相关文件,涉及原线粒体等细菌对细胞器DNA聚合酶多样性的进化贡献研究,共含2个文件。

文件详解

  • 文件名称:README.md
  • 文件格式:MD
  • 字段映射介绍:包含数据集描述及文件结构说明,解释解压后子文件夹(DNAP_phylogeny、Euk_340_genes、SRA_assemblies、Tsukubamonas_Fabomonas_assemblies)的内容框架,如DNAP_phylogeny含DNA聚合酶比对文件和系统发育树文件。
  • 文件名称:sup_data_20231129.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:压缩包内包含四个子文件夹,分别存储DNA聚合酶系统发育分析数据、真核生物340个基因数据、SRA组装数据、Tsukubamonas和Fabomonas的组装数据,其中DNAP_phylogeny含20个比对文件和19个树文件。

数据来源

Harada et al. 论文“Encyclopaedia of family A DNA polymerases localized in organelles: Evolutionary contribution of bacteria including the proto-mitochondrion”

适用场景

  • 细胞器DNA聚合酶进化研究: 分析A家族DNA聚合酶在细胞器中的定位及原线粒体等细菌对其多样性的进化贡献。
  • 真核生物基因进化分析: 利用Euk_340_genes数据研究真核生物基因与细胞器DNA聚合酶的关联进化。
  • 系统发育树构建与验证: 使用DNAP_phylogeny中的比对文件和树文件,验证DNA聚合酶的系统发育关系。
  • 原核生物与真核生物共生进化研究: 探究原线粒体等细菌通过基因转移影响真核生物细胞器DNA聚合酶的机制。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 275.49 MiB
最后更新 2025年12月27日
创建于 2025年12月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。