数据集概述
本数据集为论文“A genome-wide optical pooled screen reveals regulators of antiviral responses”的补充数据集,包含5个文件,涵盖全基因组筛选的基因水平特征、单细胞次级筛选特征、IRF3易位评分及过氧化物酶体与病毒特征评分等内容,支持抗病毒反应调节因子的筛选与分析研究。
文件详解
- Supplementary Dataset 1:全基因组筛选所有通道的基因平均提取特征,文件格式.csv
- Supplementary Dataset 2:次级抗体筛选的单细胞特征,文件格式.csv
- Supplementary Dataset 3:次级报告基因筛选的单细胞特征,文件格式.csv
- Supplementary Dataset 4:初级/次级IRF3抗体、报告基因筛选(仙台病毒及VSV感染)的IRF3易位评分与次级抗体筛选的仙台病毒强度评分,文件格式.csv,包含gene_symbol(基因符号)、fdr_bh_adj_p_primary(初级筛选校正P值)、mean_transloc_primary(初级筛选平均易位值)等字段
- Supplementary Dataset 5:全基因组筛选的过氧化物酶体与仙台病毒特征评分,文件格式.xlsx
数据来源
论文“A genome-wide optical pooled screen reveals regulators of antiviral responses”
适用场景
- 抗病毒反应调节因子筛选: 利用基因水平特征与单细胞数据,识别调控抗病毒反应的关键基因
- IRF3信号通路研究: 分析不同筛选条件下的IRF3易位评分,探究其在抗病毒反应中的作用机制
- 病毒感染机制分析: 结合仙台病毒、VSV感染数据,研究病毒与宿主细胞的相互作用
- 基因组筛选技术验证: 评估全基因组光学 pooled screen 技术在功能基因筛选中的应用效果