数据集概述
本数据集为论文《Evolutionary Study of the Bacterial Cell Wall: An examination of functions in Bacteria with contrasting lifestyles》的补充表格,包含表A4和表A6。表A4记录沙门氏菌基因组中Lpp蛋白匹配及基因组信息,表A6记录非CPR与CPR细菌基因组中肽聚糖相关酶活性的隐马尔可夫模型(HMM)搜索结果,支持细菌细胞壁功能进化研究。
文件详解
- 文件名称:Tables A4-A6.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:
- 表A4:包含沙门氏菌(Salmonella enterica subsp. enterica)基因组的Lpp蛋白匹配结果及基因组基础信息相关字段
- 表A6:包含非CPR与CPR细菌基因组的肽聚糖(PG)相关酶活性HMM搜索匹配结果相关字段
数据来源
Marcos Peñalver的论文《Evolutionary Study of the Bacterial Cell Wall: An examination of functions in Bacteria with contrasting lifestyles》
适用场景
- 细菌细胞壁进化研究: 分析不同生活方式细菌的细胞壁相关基因功能差异与进化规律
- 沙门氏菌基因组分析: 基于表A4研究沙门氏菌Lpp蛋白分布及基因组特征
- 肽聚糖代谢酶研究: 利用表A6的HMM搜索结果,探究CPR与非CPR细菌的肽聚糖相关酶活性差异
- 微生物比较基因组学: 整合基因组信息与功能基因数据,开展细菌功能基因组比较分析