数据集概述
本数据集围绕入侵野猪（Sus scrofa）的祖先谱系展开分析，通过高密度单核苷酸多态性基因型对比，揭示其野生与家养混合遗传背景对入侵扩张的影响。数据包含参考集元数据、入侵野猪元数据、基因型文件及分析代码，共8个文件，为理解入侵物种形成机制提供支持。
文件详解
- 元数据文件
- 文件名称：S2_ReferenceSet_Metadata_Ancestry.xlsx、S1_InvasiveFeralSwine_Metadata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：分别记录参考基因组数据集和入侵野猪样本的元数据信息，支撑遗传分析的样本背景追溯
- 基因型数据文件
- 文件名称：Sus_scrofa_ReferenceSet.bed、Sus_scrofa_ReferenceSet.fam、Sus_scrofa_ReferenceSet.bim
- 文件格式：BED、FAM、BIM
- 字段映射介绍：包含参考基因组的高密度单核苷酸多态性基因型数据，用于祖先谱系的遗传对比分析
- 分析代码文件
- 文件名称：Smyser_etal_FeralSwineAncestryComposition.R、Smyser_etal_FeralSwineAncestry.R、Smyser_etal_FeralSwineAncestry_MappingComposition.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于入侵野猪祖先组成分析、遗传映射分析的代码脚本，支持复现研究中的遗传分析流程
适用场景
- 入侵物种遗传机制研究: 分析入侵野猪野生与家养混合谱系的遗传背景，探究其入侵扩张的遗传驱动因素
- 生物入侵防控策略制定: 基于遗传分析结果，为入侵野猪的源头追溯和防控措施提供科学依据
- 物种适应性进化研究: 研究混合遗传背景对入侵物种环境适应性及入侵潜力的影响机制
- 遗传数据分析方法应用: 利用基因型文件和分析代码，开展入侵物种遗传谱系分析的方法学实践
