数据集概述
本数据集为海龙目鱼类系统基因组学研究数据，基于超保守元件（UCEs）分析海龙目鱼类的快速辐射进化关系。包含序列比对、组装文件、系统发育树、分析输出等7个文件，支持解析海龙目鱼类主要类群的系统发育关系，验证传统长吻类群单系性及基部快速辐射假说。
文件详解
- AccessionInfo.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含海龙目鱼类样本的生物项目编号（BioProject）、生物样本编号（BioSample）、序列登录号（Accession）及物种名称（Organism）等元数据信息。
- uce_alignments.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含超保守元件序列比对文件。
- trinity_assemblies_dryad.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含Trinity组装得到的转录组序列文件。
- trees.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含系统发育树文件。
- ExaBayes_output.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含ExaBayes软件的分析输出文件。
- concatenated_alignments.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含 concatenated 序列比对文件。
- ASTRAL_input_output.zip
- 文件格式：ZIP（压缩包）
- 内容说明：包含ASTRAL软件的输入与输出文件。
数据来源
论文“Phylogenomic analysis of a rapid radiation of misfit fishes (Syngnathiformes) using ultraconserved elements”
适用场景
- 鱼类系统发育研究: 分析海龙目鱼类主要类群的系统发育关系，验证传统分类假说。
- 生物进化机制研究: 探究海龙目鱼类基部快速辐射的进化模式及形态功能创新机制。
- 超保守元件应用验证: 评估超保守元件在解析深层系统发育关系中的有效性。
- 分子系统学方法比较: 对比不同系统发育分析方法（如贝叶斯、最大似然、ASTRAL）的结果差异。
