数据集概述
本数据集包含五种Takifugu鱼类(两种溯河洄游、两种广盐洄游海洋种、一种严格海洋种)的淡水适应能力实验及离子转运基因转录分析数据。涵盖低盐环境驯化实验结果、鳃和肠组织转录组数据,以及cftr和ncc基因的qPCR验证结果,共二十二个文件,用于研究洄游生活史相关的渗透压调节机制进化。
文件详解
- qPCR验证结果文件
- 文件名称:
cftr_qPCR_result.xlsx、ncc_qPCR_result.csv
- 文件格式:XLSX、CSV
- 字段映射介绍:包含样本部位(如anterior_intestine)、处理组(control)、基因表达量、物种等字段,记录cftr和ncc基因的定量表达数据
- 转录组表达量文件
- 文件名称:遵循
[物种缩写]-sal[盐度]-[组织]_[重复]_(paired)_(GE).xlsx模式(如toc-sal0_1-gill_1_(paired)_(GE).xlsx)
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录不同盐度(sal0_1、sal1、sal30)处理下,五种Takifugu鱼类鳃(gill)和肠(inte)组织的基因表达量数据,包含样本重复信息
数据来源
论文“Capacity for freshwater acclimation and differences in the transcription of ion transporter genes underlying different migratory life histories of Takifugu fish”
适用场景
- 鱼类洄游适应性进化研究: 分析不同洄游生活史Takifugu鱼类的淡水适应能力差异及分子机制
- 离子转运基因功能验证: 研究cftr和ncc基因在渗透压调节中的转录调控模式
- 广盐性与狭盐性鱼类生理差异分析: 比较严格海洋种与洄游种在低盐环境下的基因表达响应
- 水产养殖环境适应性评估: 为Takifugu属鱼类的低盐驯化养殖提供生理和分子数据支持