数据集概述
本数据集为Tanakaea属（虎耳草科）植物演化与种群稳定性研究的配套数据，包含叶绿体基因组序列、基因组单核苷酸多态性、形态特征测量及性别分化等多维度数据，用于验证残遗植物演化停滞与种群稳定性假说，揭示繁殖性状演化对其长期存活的作用。
文件详解
- 叶绿体基因组相关文件
- 文件名称：LSC_depth4.fas、SSC_depth4.fas、IRa_depth4.fas、CpGenome.tree、CpGenomeBEASTinput.xml
- 文件格式：FAS、TREE、XML
- 字段映射介绍：包含叶绿体基因组不同区域（LSC、SSC、IRa）的序列数据，以及用于系统发育分析的BEAST输入文件和树文件，记录物种间的演化关系。
- MIG-seq遗传数据文件
- 文件名称：MIG-seq_Honshu_stairway_filtered.vcf等6个VCF文件、MIG-seq_Populations_Analysis_Filtered.str、MIG-seq_Populations_Analysis_Filtered.phy
- 文件格式：VCF、STR、PHY
- 字段映射介绍：包含不同地理种群（日本本州、四国，中国峨眉山、洪雅等）的过滤后单核苷酸多态性数据，以及用于种群遗传分析的输入文件，记录种群遗传分化信息。
- 形态与性别数据文件
- 文件名称：Morpho_Data_tanakaea2.csv、Morpho_Data_tanakaea_PCA.csv、Sex_Data_tanakaea.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含标本ID、物种、种群、叶片长度/宽度、叶柄长度、花序长度、毛状体特征等形态测量数据，以及性别分化数据，支持形态特征分析与主成分分析。
- 说明文件
- 文件名称：README.txt.str
- 文件格式：STR
- 字段映射介绍：数据集说明文档，提供文件内容概述与使用指引。
数据来源
论文“Stable persistence of relict populations involved evolutionary shifts of reproductive characters in the genus Tanakaea (Saxifragaceae)”
适用场景
- 植物进化生物学研究: 分析Tanakaea属植物的演化历史、物种分化时间及种群遗传结构。
- 残遗植物适应性演化分析: 探究繁殖性状（雌雄异株/克隆繁殖）转变对残遗种群长期存活的影响。
- 植物形态学研究: 利用叶片、茎、花序等形态特征数据，分析种内与种间形态分化。
- 种群遗传学研究: 基于基因组多态性数据，评估不同地理种群的遗传多样性与分化程度。
- 生物地理学研究: 结合地理分布与遗传数据，揭示残遗植物的避难所分布与种群动态历史。
