数据集概述
本数据集围绕船蛆内共生菌Teredinibacter turnerae的遗传分化展开，包含25株来自三大洋13种船蛆的菌株基因序列分析结果，涉及16S rRNA及5个蛋白编码基因的多样性研究，揭示该共生菌存在两个遗传分支及基因重组现象。
文件详解
- 系统发育树文件（压缩包）
- 文件名称：Figure 1 Bayesian trees.zip、Figure S2 Bayesian trees.zip、Figure S3 ML trees.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基于不同基因位点构建的贝叶斯树和最大似然树（ML trees），用于展示菌株的系统发育关系
- 贝叶斯树文件
- 文件名称：Figure S4_recA1 A2 Bayesian tree.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：基于recA基因片段构建的贝叶斯树数据，记录菌株在该基因位点的遗传分化情况
- 基因分析文档
- 文件名称：recA of Teredinibacter turnerae strains T8412, T8503, and T8513.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：针对3株特定菌株recA基因的分析内容，可能包含基因序列特征、重组事件描述等信息
数据来源
论文“Genetic differentiation among isolates of Teredinibacter turnerae, a widely occurring intracellular endosymbiont of shipworms”
适用场景
- 微生物遗传多样性研究: 分析Teredinibacter turnerae在全球船蛆宿主中的遗传分化模式与地理分布关联
- 共生菌进化分析: 基于系统发育树探究该内共生菌的进化分支及基因交流机制
- 基因重组事件研究: 验证不同菌株间的同源重组及横向基因转移现象
- 微生物生态学研究: 辅助理解船蛆-共生菌共生体系的生态适应性与演化过程
