数据集概述
本数据集记录了嗜热四膜虫在低pH胁迫与高种群密度条件下的进化实验结果,包含4种基因型的进化适应数据,涉及内禀增长率(r0)、种内竞争能力(α)等关键参数的变化,以及不同基因型在胁迫条件下的适应策略差异,共包含9个相关文件。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:04_strain_traits_simplified.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含菌株(strain)、pH偏好(pHpref)、低pH内禀增长率(r0lowpH)、低pH竞争能力(alfalowpH)、正常pH内禀增长率(r0normalpH)、正常pH竞争能力(alfanormalpH)等字段
- 文件名称:pHcurve_medium_BIO309.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录pH曲线相关实验数据
- 其他文件
- 文件名称:posteriorBH_means.RData、extinctExcludedEvolutiondata.RData、Ancestral_EvolvedLines_PopulationDensities.RData、DensitiesDuringEvolution.RData、traitdata.RData
- 文件格式:RData
- 字段映射介绍:存储进化实验相关的后验数据、进化数据、种群密度数据、性状数据等
- 文件名称:04_strain_traits
- 文件格式:无扩展名
- 字段映射介绍:菌株性状相关数据文件
- 文件名称:04_strain_traits_simplified.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:简化版菌株性状数据,包含菌株及不同pH条件下的关键参数
数据来源
论文“Evolution under pH stress and high population densities leads to increased density-dependent fitness in the protist Tetrahymena thermophila”
适用场景
- 进化生物学研究:分析生物在非生物胁迫与高密度条件下的进化适应机制
- 种群生态学分析:探究种群密度对生物适应策略的影响
- 基因型适应性研究:比较不同基因型在胁迫环境中的进化路径差异
- 生态进化反馈机制研究:验证生态条件与进化过程的相互作用关系
- 实验进化数据分析:支持进化实验中关键参数(如r0、α)的变化趋势研究