数据集概述
本数据集为研究调节性T细胞（Treg）克隆不稳定性的补充数据，包含单细胞RNA测序、微生物组测序及数学建模相关文件，用于识别Treg分化过程中差异表达基因及微生物群落多样性分析。
文件详解
该数据集包含三个目录的文件，具体说明如下：
- 单细胞RNA测序 - Figure 4 - Figure S10/ 目录：
- Table S4.xlsx：Excel格式文件，内容未详细说明
- Table S2. Differentially expressed genes during Treg de-differentiation.xlsx：Excel格式文件，记录Treg去分化过程中的差异表达基因
- Table S1. xlsx Custom panel single cell RNA sequencing for the BD Rhapsody.：Excel格式文件，BD Rhapsody单细胞RNA测序的定制面板信息
- Table S3 List of analysed Treg signature genes AbSeq.xlsx：Excel格式文件，分析的Treg特征基因列表（AbSeq技术）
- 微生物组测序 - Figure S3/ 目录：
- fecal samples sequencing CoH and SPF housed_metadata.xlsx：Excel格式文件，SPF和共饲养（CoH）小鼠粪便样本测序元数据
- genera_10K_table.csv：CSV格式文件，包含属水平的微生物丰度数据，字段示例有g_Faecalibacterium、g_Escherichia/Shigella等
- tabel S5 - Wilcoxon tests results for phylum and genera differentially associated to SPF and CoH mice.：无扩展名文件，SPF与CoH小鼠门和属水平差异的Wilcoxon检验结果
- 数学建模 of ex-Foxp3 kinetics. - Figure S5/ 目录：
- Supplementary Code 1.Rmd：R Markdown格式文件，ex-Foxp3动力学数学建模的补充代码
- Supplementary Data 1 - Mathematical modeling of ex-Foxp3 kinetics.RData：R数据格式文件，ex-Foxp3动力学数学建模的补充数据
适用场景
- 免疫学研究：分析Treg细胞在转移后的基因表达变化及不稳定性机制
- 微生物组分析：探究SPF与共饲养小鼠肠道微生物群落的差异
- 生物信息学：单细胞RNA测序数据的差异表达基因分析
- 数学建模：Treg细胞Foxp3表达动力学的模型构建与验证
- 细胞生物学：研究Treg细胞分化过程中的分子特征变化
