数据集概述
本数据集来自论文“Recovery from hybrid breakdown reveals a complex genetic architecture of mitonuclear incompatibilities”，通过实验进化方法研究桡足类Tigriopus californicus杂交崩溃恢复过程中的有丝分裂核不相容性遗传结构。包含适应性进化后的基因频率变化、存活与繁殖力数据，以及基因组序列信息，总计10个文件，支持对有丝分裂核互作及基因流动障碍的分析。
文件详解
- 说明文档（.txt格式）
- 文件名称：README_fitness_data.txt、README_SC_eq_TCALIF.txt、README_SCNxSD_counts_AF_pValue_peakID.txt、README_SDxSCN_counts_AF_pValue_peakID.txt、README_TCALIF_eq_SC.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：各文件分别说明对应数据的内容逻辑，如fitness_data.xlsx的原始数据字段（存活、繁殖力、sensus测量值）、基因频率变化数据的统计指标（计数、等位基因频率、p值、峰值ID）及基因组序列的匹配规则。
- 数据文件（.xlsx格式）
- 文件名称：fitness_data.xlsx、SCNxSD_counts_AF_pValue_peakID.xlsx、SDxSCN_counts_AF_pValue_peakID.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：fitness_data包含9个月实验后的存活、繁殖力原始数据及均值/标准差；基因频率文件包含不同杂交组合（SCNxSD、SDxSCN）的基因计数、等位基因频率、显著性p值及峰值区域ID。
- 序列文件（.fa格式）
- 文件名称：SC_eq_TCALIF.fa、TCALIF_eq_SC.fa
- 文件格式：FA（FASTA）
- 字段映射介绍：存储Tigriopus californicus不同种群（SC、TCALIF）的基因组序列信息，用于基因比对与遗传结构分析。
数据来源
论文“Recovery from hybrid breakdown reveals a complex genetic architecture of mitonuclear incompatibilities”
适用场景
- 有丝分裂核不相容性研究：分析桡足类杂交后代中核基因与线粒体基因的互作机制及适应性进化过程。
- 遗传结构分析：通过基因频率变化数据，探究杂交崩溃恢复过程中的多基因遗传架构。
- 进化适应性评估：利用存活与繁殖力数据，评估不同线粒体背景下核等位基因的选择效率。
- 基因流动障碍研究：基于基因组序列与频率数据，解析近缘类群间基因流动的基因组水平障碍机制。
