TIMBR_Based_肝细胞毒性诱导代谢改变基因组表征数据

数据集概述

本数据集基于暴露于四种毒物(对乙酰氨基酚、四氯化碳、二噁英、三氯乙烯)的大鼠原代肝细胞转录组数据,通过TIMBR算法预测肝脏毒性生物标志物,并与代谢组学数据对比,识别TCA循环、碳水代谢等通路的代谢改变,为毒理学代谢响应机制研究提供支持,包含7个文件。

文件详解

  • 数据文件(Data files)
  • 文件名称:Rawls_Supplementary_data1.xlsx至Rawls_Supplementary_data6.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含肝细胞暴露于毒物后的转录组约束代谢网络重构数据、TIMBR算法预测的生物标志物数据、配对的新鲜/消耗培养基代谢组学数据,以及代谢通路(如TCA循环、ATP生成)改变的分析结果。
  • 文档文件(Document files)
  • 文件名称:Hepatocyte_Toxicology_Data_Supplement_081219.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:肝细胞毒性数据的补充说明文档,包含实验设计、数据处理流程及结果解读的详细描述。

数据来源

论文“Genome-scale characterization of toxicity-induced metabolic alterations in primary hepatocytes”

适用场景

  • 肝脏毒理学机制研究: 分析四种毒物诱导的肝细胞代谢通路(TCA循环、碳水代谢)改变及ATP生成中断机制。
  • 代谢生物标志物开发: 利用TIMBR预测结果与代谢组学数据的对比,筛选肝脏毒性特异性代谢标志物。
  • 多组学整合分析: 结合转录组与代谢组数据,构建毒理学响应的多组学关联框架。
  • 代谢网络模型优化: 基于预测与实验数据的差异,提出代谢网络模型的改进假设与验证方向。
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 8.43 MiB
最后更新 2026年1月29日
创建于 2026年1月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。