数据集概述
本数据集为Timema cristinae竹节虫的表型性状全基因组关联定位数据，包含10个表型性状的测量值与211,004个单核苷酸多态性（SNPs）数据，用于分析不同宿主植物间受选择强度差异的性状遗传结构，识别关联SNP位点，为该物种适应性进化的基因位点研究提供基础。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README_for_Tcris_FHA_phenotypes.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：描述表型数据文件的变量与内容，包含个体ID、性别、表型分组、拍摄日期及颜色相关测量值等字段说明
- 表型数据文件
- 文件名称：Tcris_FHA_phenotypes.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含individual（个体ID）、sex（性别）、phenotype（表型分组）、date（拍摄日期）、h_green（绿色色调）、s_green（绿色饱和度）、b_green（绿色明度）、lhue_ave（平均亮度色调）等10个表型性状的测量字段
- SNP关联数据文件
- 文件名称：Tcris_pimass_FHA_hiPIP_snp.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含snp_id（SNP编号）、trait（性状名称）、PIP_rb（后验包含概率）、B_rb（回归系数）等关联分析结果字段
- 压缩数据文件
- 文件名称：Tcris_fin_mod_snpcntII.txt.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含SNP计数相关数据文件
- 文件名称：Tcris_pimass_composite_genotypes.txt.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含复合基因型数据文件
数据来源
标题为“Data from: Genome-wide association mapping of phenotypic traits subject to a range of intensities of natural selection in Timema cristinae”的研究数据
适用场景
- 进化生物学研究：分析自然选择强度下表型性状的遗传结构与种群分化关系
- 基因组关联分析：利用SNP与表型数据定位适应性性状相关的基因位点
- 适应性进化机制研究：探究Timema cristinae对不同宿主植物的适应性性状遗传基础
- 遗传多样性分析：通过SNP数据评估种群内的遗传变异水平与结构
- 表型-基因型关联验证：验证已识别SNP位点对表型性状变异的解释力与效应大小
