数据集概述
本数据集包含研究体内武装巨噬细胞抑制肝转移机制的相关数据,涉及单细胞RNA测序、空间转录组(MERFISH)、全外显子测序(WES)等多组学数据及UMAP可视化结果,支持肿瘤免疫治疗机制研究。
文件详解
- 目录结构:数据集包含一个主目录
In vivo armed macrophages curb liver metastasis through tumor-reactive T-cell rejuvenation/,目录深度为一
- 核心文件:
- 15个CSV格式文件,主要为UMAP可视化结果文件,示例如下:
liver_apcs_umap_FigS11A-1.csv:包含UMAP坐标(UMAPh_1、UMAPh_2)、组织类型(Tissue)、样本来源(orig.ident)、细胞分组(RNA_Group)、细胞ID(cell_ID)等字段
AKTPF_TandNK_umap_Fig6B.csv:包含T细胞与NK细胞的UMAP坐标及相关样本信息
Liver_umap_Fig2A.csv:肝脏组织细胞的UMAP可视化数据
Tumor_umapAPC_Fig2D.csv:肿瘤组织中抗原呈递细胞的UMAP数据
TAD12_TandNK_umap_FigS7I_S7J_S7K.csv:包含OVA反应性标记(OVA.reactive)的T细胞与NK细胞UMAP数据
适用场景
- 肿瘤免疫学研究:分析体内武装巨噬细胞对肿瘤反应性T细胞的调控机制
- 肝转移治疗机制研究:探究免疫细胞相互作用在肝转移抑制中的作用
- 单细胞转录组数据分析:验证UMAP可视化结果与细胞亚群分类的相关性
- 免疫治疗靶点筛选:挖掘肿瘤微环境中关键免疫细胞的功能特征
- 生物信息学方法应用:复现多组学数据整合分析的流程与结果