数据集概述
本数据集为R包TipDatingBeast的辅助数据，支持使用BEAST进行系统发育末端定年测试。数据包含两种核心功能相关文件：用于日期随机化分析的XML配置文件，以及用于留一法分析的日志压缩文件，可辅助评估数据集时间信号、校准序列一致性及潜在偏差。
文件详解
- XML配置文件（共2个）
- 文件名称：Flu_BEAST_232.xml、Flu_BEAST_18.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST分析的配置文件，包含系统发育末端定年测试的参数设置、序列数据关联及分析流程定义
- 日志压缩文件（共2个）
- 文件名称：LOOCV logs.zip、DRT_logs.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩归档文件，分别存储留一法分析（LOOCV）和日期随机化分析（DRT）的日志数据，用于结果验证与偏差定位
数据来源
R包TipDatingBeast项目
适用场景
- 系统发育末端定年测试：辅助使用BEAST工具实现分子序列的末端定年分析，评估进化事件时间与分子进化速率
- 时间信号评估：通过日期随机化分析配置文件，检验数据集的时间信号强度
- 校准序列一致性验证：利用留一法分析日志，测试独立校准序列间的一致性并定位潜在偏差来源
- 生物信息学工具开发：为R包TipDatingBeast的功能验证与优化提供测试数据支持
