数据集概述
本数据集为基于DIA质谱技术的蛋白质互作分析数据，围绕TMEM55B与RILPL1结合机制展开，包含两组对比实验的搜索结果及完整的LC和DIA-MS参数，用于揭示溶酶体适配器组装的保守TBM基序作用，共3个文件。
文件详解
- Table1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：TMEM55B野生型（WT）与R151E突变体免疫沉淀（IP）在LRRK2 Y1699C和Rab8A Q67L存在下的DIA质谱搜索结果，对应论文图3A
- Table2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：TMEM55B野生型在LRRK2 Y1699C（激酶活性型）与LRRK2 Y1699C D2017A（激酶失活型）+Rab8A Q67L条件下的IP-DIA质谱搜索结果对比，对应论文图3C
- Table3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：完整的液相色谱（LC）和数据非依赖型质谱（DIA-MS）实验参数，对应论文中LC-MS/MS分析部分
数据来源
论文“Structural basis for binding of RILPL1 to TMEM55B reveals a lysosomal platform for adaptor assembly through a conserved TBM motif”
适用场景
- 蛋白质互作机制研究：分析TMEM55B野生型与突变体的互作蛋白差异，揭示RILPL1结合的结构基础
- 激酶活性调控分析：对比LRRK2活性型与失活型对TMEM55B互作网络的影响
- 溶酶体生物学研究：探索溶酶体适配器组装的保守TBM基序功能及相关蛋白平台作用
- 质谱实验方法参考：基于完整LC和DIA-MS参数优化蛋白质组学实验设计
