数据集概述
本数据集为论文“A comprehensive atlas of the bonobo gut bacteriome and its associated host and exposome factors”（Torfs et al. 2025, Cell Reports）的分析用数据，包含倭黑猩猩肠道细菌组的样本信息、物种计数、分类注释及圈养与野生个体间的相似性数据，共5个文件，支持肠道细菌组与宿主及环境因素关联研究。
文件详解
- 01 Sampledata.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含倭黑猩猩样本的基础信息，推测涵盖宿主特征、暴露因素等与肠道细菌组关联的元数据
- 02 Dyadic similarity - Zoo vs Wild.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录圈养与野生倭黑猩猩个体间肠道细菌组的二元相似性数据
- 03 Dyadic similarity - WithinZoo.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录圈养倭黑猩猩群体内部个体间肠道细菌组的二元相似性数据
- 04 Counts taxon per sample.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含count（物种计数）、sample_id（样本ID）、taxon_id（分类单元ID）字段，记录每个样本中各细菌分类单元的数量
- 05 Taxa annotation.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含kingdom（界）、phylum（门）、class（纲）、order（目）、family（科）、genus（属）、species（种）、sequence（序列）、taxon_id（分类单元ID）字段，记录细菌分类单元的注释信息
数据来源
论文“A comprehensive atlas of the bonobo gut bacteriome and its associated host and exposome factors”（Torfs et al. 2025, Cell Reports）
适用场景
- 微生物组图谱构建：基于物种计数与分类注释数据，绘制倭黑猩猩肠道细菌组的组成结构图谱
- 宿主与环境因素关联分析：结合样本元数据，研究宿主特征、暴露组因素与肠道细菌组的关联性
- 圈养与野生群体比较：利用二元相似性数据，分析圈养与野生倭黑猩猩肠道细菌组的差异及群体内相似性特征
- 微生物分类学研究：通过分类注释信息，探索倭黑猩猩肠道细菌的系统发育关系与物种多样性
