数据集概述
本数据集围绕头足类系统发育关系推断展开，包含转录组数据处理相关的核心直向同源集、串联数据文件、系统发育树文件及分析脚本，通过配套说明文档支持研究复现，为评估转录组数据在头足类系统发育研究中的效用提供完整资源。
文件详解
- 说明文档文件：
- cephalopod_core_ortholog_set_readme.txt：TXT格式，介绍头足类核心直向同源集的相关信息
- tree_files_readme.txt：TXT格式，说明系统发育树文件的内容与结构
- scripts_readme.txt：TXT格式，提供脚本文件的功能与使用说明
- data_files_readme.txt：TXT格式，阐述数据文件的组成与背景
- 压缩包文件：
- cephalopod-core-ortholog-set.zip：ZIP格式，包含头足类核心直向同源集数据
- scripts.zip：ZIP格式，存储研究中使用的分析脚本，如ceph_hamstr_outtofastas.sh（将HaMStR输出转换为直向同源组FASTA文件）、ceph_groups_to_pruned.sh（对FASTA文件进行比对并推断似然树）等
- data_files.zip：ZIP格式，包含串联数据文件等研究数据
- tree_files.zip：ZIP格式，存储系统发育树相关文件
适用场景
- 分子系统发育研究：用于分析转录组数据在头足类系统发育关系推断中的有效性
- 生物信息学方法评估：探究直向同源基因集构建、序列比对及系统发育树推断等方法的性能
- 头足类演化分析：支持头足类物种间亲缘关系与演化历史的相关研究
- 转录组数据应用研究：为转录组数据在系统发育研究中的应用提供案例参考
