数据集概述
本数据集为论文配套数据，包含入侵棕榈Trachycarpus fortunei在瑞士南部及意大利北部群体的微卫星与SNP标记分析结果，记录了208个样本的基因型数据，用于揭示该物种的随机交配模式和主动殖民过程，是研究其入侵机制的核心遗传信息资源。
文件详解
- GBS分析文件
- 文件名称：variants.vcf.gz
- 文件格式：VCF.GZ
- 字段映射介绍：未过滤的压缩VCF文件，包含208个样本、73685个标记（对应36195个基因座）的原始基因型数据
- 文件名称：variants.filt.vcf.gz
- 文件格式：VCF.GZ
- 字段映射介绍：过滤后的压缩VCF文件，移除了缺失基因型超过百分之五十的样本（剔除样本6CL）及样本覆盖率低于百分之八十、最小等位基因频率低于百分之一的标记，最终保留207个样本、31312个标记（对应19301个基因座）
- 微卫星数据文件
- 文件名称：TFT.fortunei_Microsatellites_FSTATFINAL_Pop.dat
- 文件格式：DAT
- 字段映射介绍：适用于FSTAT软件的微卫星分析终稿文件，包含群体遗传学分析所需的微卫星标记数据
- 样本信息文件
- 文件名称：Trachycarpus_Samples_sheet.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：实验室提取样本的清单列表，记录样本基础信息
数据来源
论文“Panmixia and active colonisation of the invasive palm Trachycarpus fortunei (Arecaceae) in Southern Switzerland and Northern Italy as inferred by microsatellites and SNP markers”
适用场景
- 入侵物种群体遗传学研究：分析Trachycarpus fortunei的随机交配模式、基因流及群体结构，揭示其入侵机制
- 遗传标记筛选应用：对比未过滤与过滤后的VCF文件，优化入侵物种遗传分析的标记筛选策略
- 生物入侵监测：利用样本基因型数据追踪该物种在欧洲南部的扩散路径与殖民动态
- 微卫星数据分析方法验证：基于DAT文件测试FSTAT软件在入侵植物群体遗传研究中的应用效果
