数据集概述
本数据集是研究表型性状变化与位点特异性序列进化关联的配套数据,包含应用TraitRateProp方法分析的兰花质体基因及OM基因结果、补充表格和修订补充材料。其中TraitRateProp是用于检测二元表型性状与序列进化速率关联的概率方法,数据集支持验证该方法及研究异养生活方式对植物质体基因组进化的影响,共含5个文件。
文件详解
- 压缩文件(Archive files)
- 文件名称:TRP_on_orchid_genes.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含TraitRateProp方法应用于兰花质体基因分析的相关数据
- 文件名称:TRP_on_OM_genes.rar
- 文件格式:RAR
- 字段映射介绍:包含TraitRateProp方法应用于OM基因分析的相关数据
- 数据文件(Data files)
- 文件名称:SuppTable_S1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:研究相关的补充表格S1,具体内容未提供预览
- 文件名称:SuppTable_S2.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:研究相关的补充表格S2,具体内容未提供预览
- 文档文件(Document files)
- 文件名称:revised_SuppMaterial_TraitRateProp.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:TraitRateProp方法的修订补充材料文档
数据来源
论文“An integrated model of phenotypic trait changes and site-specific sequence evolution”
适用场景
- 生物信息学方法验证: 用于评估TraitRateProp方法在表型性状与序列进化关联分析中的性能
- 植物基因组进化研究: 分析异养生活方式转变对兰花质体基因进化速率的影响
- 表型-基因型关联分析: 探索二元表型性状与基因组序列进化速率的关联模式
- 功能约束位点检测: 识别因表型性状转变导致进化速率显著变化的特定序列位点
- 生物统计方法应用: 为统一分析序列数据与表型数据的统计框架提供实例数据支持