数据集概述
本数据集包含对Tribolium数据集进行交互式分析(Workflow I)的导出与处理数据,聚焦三个已分析的感兴趣区域(ROI)。数据以结构化目录存储,包含原始图像、衍生处理图像、元数据及粒子分析表等,总计三十九份文件,支持生物图像分析流程的复现与验证。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:
README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:数据集说明文档,可能包含分析流程、文件结构等信息
- 原始图像文件
- 文件名称:
Exported Image/image.tiff
- 文件格式:TIFF
- 字段映射介绍:原始导出图像文件
- ROI矢量数据
- 文件名称:遵循
Exported Image/rois/id-[编号]/vector.csv模式(如id-5196/vector.csv)
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:ROI区域的矢量坐标数据
- 元数据文件
- 文件名称:遵循
[目录路径]/meta.json模式(如id-5196/meta.json)
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:对应图像或数据的元信息,包含处理参数、标识ID等
- 衍生处理图像
- 文件名称:遵循
[目录路径]/image.tiff模式(如裁剪、去噪、最大强度投影、阈值处理后的图像文件)
- 文件格式:TIFF
- 字段映射介绍:经裁剪、CARE去噪、最大强度投影、Otsu阈值处理等步骤生成的衍生图像
- 粒子分析表
- 文件名称:遵循
[目录路径]/tables/id-[编号]/table.csv模式(如id-201/table.csv)
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:对阈值处理后图像进行粒子分析得到的结构化数据
数据来源
MPI-CBG出版物网站(https://publications.mpi-cbg.de/publications-sites/7207/)
适用场景
- 生物图像分析流程复现: 用于重复交互式分析Workflow I的处理步骤,验证结果一致性
- 显微图像预处理研究: 分析裁剪、去噪、投影等预处理步骤对图像质量的影响
- 感兴趣区域(ROI)分析: 研究三个ROI区域的图像特征与粒子分布规律
- 生物图像处理算法验证: 对比不同处理算法(如CARE去噪、Otsu阈值)的效果
- 数据标准化存储参考: 作为生物图像分析结果结构化存储的示例模板