数据集概述
该数据集基于Illumina BovineSNP50芯片，对突尼斯三个本地牛种群的基因组结构与遗传历史进行研究。通过分析约三万八千个SNP位点，结合全球37个牛品种的878个个体数据，揭示了突尼斯本地牛的低分化水平、高遗传多样性及混合起源特征，为其保护策略制定提供遗传证据。
文件详解
- 文档说明文件：
- README_for_Ben-Jemaa_data_2015.tar.txt：TXT格式，说明压缩包内包含的SNP数据文件（data.map）信息，该文件含三万八千五百九十七个SNP位点，采用PLINK map格式（四列结构）
- 遗传分析结果文件：
- Unrooted_NJ_tree.pdf：PDF格式，无根邻接树（NJ树）可视化结果
- Population_NeighborNet_graph.pdf：PDF格式，种群网络（NeighborNet）结构图
- ML_Tree_No_migration_events.pdf：PDF格式，无迁移事件的最大似然树（ML树）
- ML_tree_8_migration_events.pdf：PDF格式，含八个迁移事件的最大似然树（ML树）
- 压缩数据文件：
- Ben-Jemaa_data_2015.tar.gz：GZ压缩格式，包含核心SNP数据文件
适用场景
- 动物遗传学研究：分析突尼斯本地牛的种群结构、遗传多样性及混合起源
- 生物多样性保护：为突尼斯本地牛的保护策略制定提供基因组学依据
- 比较基因组学：研究北非与欧洲、非洲牛品种的遗传关联及历史基因流
- 适应性进化分析：挖掘突尼斯本地牛适应 harsh 环境的遗传变异位点
