U2OS细胞单细胞RNA测序数据集-细胞周期分析-2011-alexandervc
数据来源:互联网公开数据
标签:单细胞RNA测序,细胞周期,细胞生物学,生物技术,数据科学,科学实验,科研,教育,探索
数据概述:
本数据集包含U2OS细胞系的单细胞RNA测序结果,数据集包含2万个观测到的单细胞及其对应的基因表达信息。其中,每一行对应一个细胞,每一列对应一个基因,矩阵中的值表示相应基因在相应细胞中的表达强度。该数据集具有很高的质量,并使用了FUCCI细胞周期标签,能够清楚地区分出在看似同质的细胞群体中两种具有“正常”和“快速”增殖的亚群。这是单细胞RNA测序领域中首次发现这种现象,相关研究详见文献https://arxiv.org/abs/2208.05229。
数据集还引用了另一篇重要文献https://www.nature.com/articles/s41586-021-03232-9,该文献使用单细胞蛋白质基因组学方法对细胞周期进行了时空解析。此外,相关的单细胞RNA测序数据集可在Kaggle等平台上找到,详见https://www.kaggle.com/alexandervc/datasets。
数据用途概述:
该数据集适用于单细胞RNA测序技术的教学、科研以及数据分析练习。具体来说,研究人员和学生可以利用该数据集进行细胞周期分析、数据可视化及初步的数据探索。此外,数据集还适用于评估单细胞RNA测序技术的挑战与局限性,帮助理解单细胞数据分析中的计算难题。该数据集对生物信息学、细胞生物学和生物技术等领域具有重要的参考价值。