数据集概述
本数据集是关于羊膜动物UCP1基因进化丢失研究的补充数据，包含方法结果文档、表格数据及BLAST查询文件等。研究通过相似性搜索和共线性分析，揭示UCP1在爬行动物谱系基部丢失，以及猪、海豚科等真兽类哺乳动物的UCP1丢失/假基因化现象，为非功能性UCP1下的体温调节和能量代谢替代机制研究提供支持。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Supplemental_File1_Methods_Results_Figures.docx
- 文件格式：DOCX
- 内容介绍：包含研究的方法、结果及图表相关补充内容
- 表格类文件
- 文件名称：Supplemental_File2_TablesSM.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 内容介绍：补充表格数据，用于呈现研究中的统计结果或数据汇总
- 文本类文件（BLAST查询与共线性分析相关）
- 文件名称：Supplemental_File3_BlastQUERY_Synteny.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：包含CLGN_ANOLE等序列信息，用于BLAST查询和共线性分析
- 文件名称：Supplemental_File4_Protein_UCP1_Query_for_TBLASTN.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：UCP1蛋白序列查询文件，用于TBLASTN分析
- 文件名称：Supplemental_File5_BlastQUERY_for_raw_reads_mammals.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：针对哺乳动物原始 reads 的 BLAST 查询文件
- 文件名称：Supplemental_File6_BlastQUERY_for_raw_reads_reptiles_birds.txt
- 文件格式：TXT
- 内容介绍：针对爬行动物和鸟类原始 reads 的 BLAST 查询文件
数据来源
论文“Here and there, but not everywhere: repeated loss of uncoupling protein 1 in amniotes”
适用场景
- 生物进化研究：分析UCP1基因在羊膜动物中的丢失模式及进化机制
- 基因功能研究：探讨UCP1基因丢失对动物体温调节和能量代谢的影响
- 比较基因组学分析：通过BLAST查询和共线性分析，研究不同物种的基因结构差异
- 分子生物学实验设计：为UCP1相关的TBLASTN分析和原始reads查询提供参考序列文件
- 生物数据挖掘：利用补充表格和方法文档，挖掘羊膜动物UCP1基因进化的关键数据
