数据集概述
本数据集为论文“Limitations of Autonomous Reef Monitoring Structures (ARMS) in Detecting Predator Effects on Coral Reef Benthic Assemblages”的配套数据,包含复现论文主要图表和补充材料所需的原始数据、R代码及PRIMER文件,支持分析ARMS在监测珊瑚礁底栖群落捕食者效应中的局限性。
文件详解
- 数据文件
- 文件名称:
data_raw.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:多工作表Excel文件,包含:
mobile_fauna:各ARMS单元移动生物丰度(R可读格式)
mobile_fauna PRIMER:PRIMER v7格式的移动生物丰度数据
sessile:各ARMS单元固着生物相对覆盖度(CATAMI分类,R可读格式)
sessile PRIMER:PRIMER v7格式的固着生物覆盖度数据
taxonomy_mobile:移动生物分类参考(门、科)
CATAMI_reference:固着生物数据集使用的CATAMI分类代码及定义
- 代码文件
- 文件名称:
codes_figures_tables.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:生成论文图表及补充表的R脚本,对应内容包括Figure 2(移动类群多样性与丰度)、Figure 3(移动动物群落mMDS排序)、Figure 5(固着群落mMDS排序)、补充表2-4(科水平丰富度与丰度 summary)
- 分析文件
- 文件名称:
PERMANOVA_shadeplot.pwk
- 文件格式:PWK
- 字段映射介绍:PRIMER v7 + PERMANOVA+工作区文件,用于多变量分析,对应内容包括论文Table 2-3(PERMANOVA结果)、Figure 4(固着覆盖度优化阴影图)
数据来源
UNAM(墨西哥国立自治大学)Damián Cedillo Reyna硕士论文,项目支持:PAPIIT IN208124
适用场景
- 珊瑚礁生态监测技术评估:分析ARMS在检测捕食者对底栖群落影响中的局限性
- 底栖生物群落数据分析:基于移动/固着生物数据开展多样性、丰度及群落结构研究
- 海洋生态学统计方法应用:利用R代码及PRIMER文件复现论文的统计分析流程(如mMDS排序、PERMANOVA)
- 珊瑚礁保护研究:为评估ARMS技术在珊瑚礁生态监测中的适用性提供数据支持