UNITE_Based真菌ITS1与ITS2元条形码标记比较研究数据

数据集概述

本数据集为真菌DNA元条形码标记比较研究数据,包含ITS1和ITS2两个区域的序列数据,涉及已知分类序列和环境扩增子焦磷酸测序数据,用于评估两者作为真菌元条形码标记的可用性。

文件详解

  • 文件名称:ITS2_basi.zip、ITS2_UNITE.zip、ITS2_asco.zip、ITS1_UNITE.zip、ITS1_basi.zip、ITS1_asco.zip
  • 文件格式:.zip
  • 字段映射介绍:数据集包含6个压缩文件,分别对应ITS1和ITS2区域的序列数据,涉及basi、UNITE、asco等分类或数据库来源的序列,用于聚类分析和分类学研究。

数据来源

论文“ITS1 versus ITS2 as DNA metabarcodes for fungi”

适用场景

  • 真菌元条形码标记评估: 比较ITS1和ITS2作为真菌DNA元条形码标记的有效性和适用性。
  • 生物信息学聚类分析: 利用ClustEx等生物信息学流程对已知分类序列进行聚类分析,确定物种相似性阈值。
  • 真菌群落多样性研究: 通过环境扩增子焦磷酸测序数据,分析真菌群落的多样性和组成。
  • 分类学数据库应用: 基于UNITE数据库等已知分类序列,验证真菌物种鉴定的准确性。
  • 引物设计优化: 分析引物错配等因素对ITS1和ITS2序列数据的影响,优化PCR引物设计。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.59 MiB
最后更新 2026年1月25日
创建于 2026年1月25日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。