VC1024_C_elegans_秀丽隐杆线虫pdr_1_gk448_基因行为实验数据_20120831

数据集概述

本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了VC1024品系(pdr-1(gk448) III突变体)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为实验数据。实验于2012年8月31日开展,采用tierpsy软件追踪,包含原始视频衍生的3个文件,可用于分析线虫的运动行为特征。

文件详解

  • 文件名称:pdr-1(gk448) on food L_2012_08_31__12_59_21___4___8.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:推测为原始行为追踪数据文件,可能包含线虫运动的时空坐标、骨架 segmentation 信息等基础数据
  • 文件名称:pdr-1(gk448) on food L_2012_08_31__12_59_21___4___8_features.hdf5
  • 文件格式:HDF5
  • 字段映射介绍:推测为行为特征提取文件,可能包含基于原始数据计算的运动速度、弯曲频率、身体姿态等表型特征
  • 文件名称:pdr-1(gk448) on food L_2012_08_31__12_59_21___4___8.wcon.zip
  • 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
  • 字段映射介绍:推测为标准化行为数据归档文件,wcon格式通常用于存储线虫行为的结构化时间序列数据

数据来源

C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org

适用场景

  • 线虫基因功能研究:分析pdr-1基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
  • 行为表型组学分析:基于追踪数据挖掘线虫运动的量化特征,构建表型图谱
  • 模式生物行为学实验复现:参考实验方案(Yemini et al.方法)开展同类线虫行为实验
  • 生物图像分析算法验证:利用标注的骨架数据测试线虫行为追踪算法的准确性
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 615.76 MiB
最后更新 2026年1月1日
创建于 2026年1月1日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。