数据集概述
本数据集属于秀丽隐杆线虫行为数据库,记录了VC1024品系(pdr-1(gk448) III突变体)成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨琼脂培养基上的行为实验数据。实验于2012年8月31日开展,采用tierpsy软件追踪,包含原始视频衍生的3个文件,可用于分析线虫的运动行为特征。
文件详解
- 文件名称:
pdr-1(gk448) on food L_2012_08_31__12_59_21___4___8.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为原始行为追踪数据文件,可能包含线虫运动的时空坐标、骨架 segmentation 信息等基础数据
- 文件名称:
pdr-1(gk448) on food L_2012_08_31__12_59_21___4___8_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:推测为行为特征提取文件,可能包含基于原始数据计算的运动速度、弯曲频率、身体姿态等表型特征
- 文件名称:
pdr-1(gk448) on food L_2012_08_31__12_59_21___4___8.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:推测为标准化行为数据归档文件,wcon格式通常用于存储线虫行为的结构化时间序列数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析pdr-1基因缺失对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型组学分析:基于追踪数据挖掘线虫运动的量化特征,构建表型图谱
- 模式生物行为学实验复现:参考实验方案(Yemini et al.方法)开展同类线虫行为实验
- 生物图像分析算法验证:利用标注的骨架数据测试线虫行为追踪算法的准确性