数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)VC1063 nlp-15(ok1512)品系在食物环境下的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了2009年6月15日采集的成年雌雄同体线虫在NGM低蛋白胨培养基上的运动行为,包含视频追踪原始数据、特征提取结果及标准化格式文件,可用于线虫行为学分析。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:nlp-15(ok1512) on food R_2009_06_15__12_11__15.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为视频的原始追踪数据,记录了299.382秒实验时长内的6680个分段骨架信息,采样帧率为25.9067帧/秒,像素分辨率为4.95268微米/像素
- 文件名称:nlp-15(ok1512) on food R_2009_06_15__12_11__15_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、身体姿态等量化特征
- 文件名称:nlp-15(ok1512) on food R_2009_06_15__12_11__15.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon文件)
- 字段映射介绍:标准化行为数据格式文件,采用wcon格式存储线虫行为时间序列数据
数据来源
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析nlp-15基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为学特征提取:基于tierpsy软件的特征数据,研究线虫在食物环境下的运动模式、速度及姿态变化
- 神经生物学机制分析:结合基因背景与行为数据,探究线虫行为的神经调控机制
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法,验证线虫行为学实验的可重复性
- 跨数据集比较:作为线虫行为数据库的一部分,支持不同品系、不同环境下的行为数据对比分析