数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了VC335品系(携带gly-2(gk204)I等位基因)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM培养基上的行为实验数据,实验于2011年8月4日由剑桥MRC分子生物学实验室完成,包含视频追踪及特征分析结果。
文件详解
- 核心数据文件
- 文件名称:gly-2 (gk204)I on food L_2011_08_04__12_54_0188.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为原始追踪数据,如骨架分割信息(共25890个分段骨架)、时间序列坐标等基础观测数据
- 特征分析文件
- 文件名称:gly-2 (gk204)I on food L_2011_08_04__12_54_0188_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的行为特征数据,基于每秒30.03帧的视频、4.89022微米/像素的分辨率生成
- 标准化格式压缩文件
- 文件名称:gly-2 (gk204)I on food L_2011_08_04__12_54_0188.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含wcon格式的行为数据压缩包,用于标准化数据交换
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 基因功能研究:分析gly-2基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 模式生物行为学分析:探究成年雌雄同体线虫在食物环境中的行为模式与特征
- 行为实验方法验证:基于E.Yemini等的实验方法,验证线虫行为观测 protocol 的可重复性
- 计算机视觉在生物研究中的应用:评估tierpsy软件对微小模式生物行为追踪的准确性与有效性