数据集概述
本数据集围绕苹果黑星病病原菌Venturia inaequalis的群体结构展开,基于11个果园606株菌株的微卫星数据,探究不同抗性基因(Rvi6、Rvi1、Rvi17)对病原菌群体的选择压力,分析毒力与非毒力群体的遗传分化及基因交流情况,为农业生态系统中病原菌与宿主的协同进化研究提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:sampling locations.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Population ID(群体编号)、Name of orchard location(果园名称)、GPS position of orchard (latitude and longitude)(果园GPS坐标,含纬度和经度)等字段,记录11个采样果园的基本信息。
- 文件名称:microsatellites dataset.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含606株苹果黑星病菌菌株的微卫星基因分型数据,用于分析病原菌群体的遗传结构、分化程度及基因流情况。
数据来源
论文“Population structure of Venturia inaequalis, a causal agent of apple scab, in response to heterogeneous apple tree cultivation”
适用场景
- 植物病原菌群体遗传学研究: 分析Venturia inaequalis群体的遗传分化、亚结构及基因交流模式。
- 农业生态系统协同进化研究: 探究苹果抗性基因(尤其是Rvi6)对病原菌群体的选择压力及毒力进化机制。
- 病害防控策略制定: 基于病原菌群体结构特征,优化苹果黑星病的抗病品种布局与防控措施。
- 微生物地理分布分析: 结合采样位置信息,研究病原菌的空间分布规律及扩散路径。