数据集概述
本数据集围绕大西洋鲑鱼(Salmo salar)成熟年龄这一关键适应性状展开,聚焦VGLL3基因的性依赖显性效应。该基因解释了成熟年龄表型变异的39%,通过促进雄性早熟、雌性晚熟减少性内冲突,维持野生种群的遗传多样性。数据集包含GWAS分析及候选区域序列等相关文件,共4个文件。
文件详解
- README文件
- 文件名称:
README_for_Barson_et_al_GenABEL.txt、README_for_Barson_et_al_candidate_region_sequences_and_QTN_table.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供数据集关联论文信息及对应数据文件的说明文档,包括研究背景、数据用途和文件内容概述。
- 压缩文件
- 文件名称:
Barson_et_al_Genabel.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含GWAS分析所用的GenABEL格式数据,含208704个SNP位点信息,覆盖NOR和TAN数据集。
- 文件名称:
Barson_et_al_candidate_region_sequences_and_QTN_table.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含VGLL3候选区域的序列数据及数量性状核苷酸(QTN)表,记录基因序列信息与关键变异位点。
数据来源
论文“Sex-dependent dominance at a single locus maintains variation in age at maturity in salmon”
适用场景
- 进化遗传学研究:分析性依赖显性基因如何解决性冲突,维持种群遗传多样性。
- 水产育种应用:利用VGLL3基因标记优化鲑鱼繁殖策略,平衡生长与成熟年龄的适应性。
- 种群管理决策:为受捕捞压力影响的鲑鱼种群提供遗传依据,指导保护野生种群成熟年龄结构。
- 基因组学方法验证:通过GWAS数据及候选区域序列,验证大效应基因在多基因性状中的作用机制。