数据集概述
本数据集为VirAnimalOne项目的初步成果,包含生物信息学分析流程文档及配套数据表。项目聚焦于挖掘ENA/SRA数据库中宠物、 livestock及野生动物的组学数据,研究内容涉及冠状病毒序列识别、宿主基因变异与病毒易感性关联、宿主受体结构分析等方向。
文件详解
- 文件名称: Technical_Report_VirAnimalOne_Pipeline.pdf
- 文件格式: PDF
- 内容: 记录并描述用于组学数据集挖掘的生物信息学流程
- 文件名称: Technical_Report_VirAnimalOne_Table_S1-S6.xlsx
- 文件格式: XLSX
- 内容: 用于挖掘活动的基因组数据集列表
- 文件名称: Technical_Report_VirAnimalOne_Table_S7.xlsx
- 文件格式: XLSX
- 内容: 参与冠状病毒感染的宿主基因列表,用于挖掘宿主基因组多态性
- 文件名称: Technical_Report_VirAnimalOne_Table_S8-S13.xlsx
- 文件格式: XLSX
- 内容: 选定的冠状病毒感染相关宿主基因中的注释变异列表
- 文件名称: Technical_Report_VirAnimalOne_Table_S14-S19.xlsx
- 文件格式: XLSX
- 内容: 从选定家养物种的下一代测序数据集中识别的病毒序列列表
适用场景
- 冠状病毒跨物种传播研究: 分析家养及野生动物中的冠状病毒序列分布
- 宿主基因与病毒易感性关联分析: 探究宿主基因变异对SARS-CoV-2等冠状病毒感染的影响
- 病毒受体结构与功能研究: 评估宿主受体构象与动物对冠状病毒易感性的关系
- 生物信息学流程参考: 为组学数据挖掘提供标准化分析流程模板
- 跨物种病毒防控研究: 支持动物源性冠状病毒的监测与防控策略制定