数据集概述
本数据集为葡萄属（Vitis L.）系统发育分析研究成果，包含48个葡萄属物种、品种及外类群共309份材料的遗传数据。基于27个非连锁核基因序列构建系统发育关系，结合化石校准估算分化时间，揭示属内广泛网状进化及气候变迁背景下的同步多样化特征，为种质资源保护与利用提供关键参考。
文件详解
- README文件
- 文件名称：README_for_Vitis phylogeography.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据基本背景与文件构成，提及用于BEAST分化时间估算的XML文件（Additional File 21_800mil10Klog_52taxaNoTiliWithCay_11437_LognRelYule3CalPts_NOpartK80G.xml）及BEAST树文件（Treefile_BEAST dating_52 OTU_236833_836_839combined_burnin10Perc_treeAnnotated）的核心用途与来源。
- 压缩包文件
- 文件名称：Vitis phylogeography.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含系统发育分析核心数据，如用于BEAST分化时间估算的XML文件（记录未分区的K80模型参数与3个校准点）、BEAST树文件（整合10次运行中最优3次结果，经10%燃烧期处理并注释，可通过Figtree查看树结构与分化时间信息）。
数据来源
论文“A phylogenetic analysis of the grape genus (Vitis L.) reveals broad reticulation and concurrent diversification during neogene and quaternary climate change”
适用场景
- 植物系统发育研究: 分析葡萄属物种间的进化关系、分化时间及网状进化模式。
- 种质资源保护: 基于遗传多样性数据，指导葡萄属野生种与栽培品种的资源收集与保护策略制定。
- 作物遗传改良: 挖掘属内未被利用的遗传多样性，为葡萄品种抗性、品质改良提供基因资源参考。
- 生物地理学分析: 结合分化时间与地理分布数据，探究葡萄属起源、扩散及气候变迁对物种形成的影响。
- 分类学修订: 基于核基因SNP数据，修正现有葡萄属物种分类体系中的错误归类问题。
