数据集概述
本数据集包含赤狐Y染色体标记的原始数据,基于赤狐基因组从头组装开发的11个新Y染色体微卫星标记及2个已知标记,对来自4个种群的76只雄性赤狐进行基因分型,涵盖单倍型数据、样本信息及标记说明,可用于分析赤狐种群遗传多样性和系统地理格局。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_Rando2017JHeredRawDataY-MarkersRedFox.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:说明数据编译者、时间及实验室信息,概述压缩包内文件结构。
- 压缩包文件
- 文件名称:Rando2017JHeredRawDataY-MarkersRedFox.zip
- 文件格式:ZIP
- 包含子文件:
- Marker and Sample Library Key.xlsx:样本及标记名称解释的Excel文件
- Individual Sample Calls.xlsx:记录每个个体最终等位基因分型结果的Excel表格
- NetworkData.ych:用于构建单倍型网络的输入数据文件
数据来源
伊利诺伊大学Anna Kukekova实验室
适用场景
- 赤狐种群遗传多样性分析: 利用单倍型数据研究不同地理种群的遗传结构与多样性水平。
- 系统地理学研究: 分析赤狐种群间的基因流模式及大陆间的遗传分化。
- 分子标记开发验证: 评估新开发的Y染色体微卫星标记在种群研究中的分辨率与适用性。
- 动物遗传学实验设计: 为其他犬科动物Y染色体标记开发及种群研究提供方法参考。