豌豆蚜宿主种群拷贝数变异动态数据集

数据集概述

该数据集记录了豌豆蚜不同宿主种群中拷贝数变异(CNV)的动态情况,涵盖434个基因(含150个化学感应基因)的CNV数据,样本来自8个宿主种群的104个个体,为研究CNV在宿主适应及物种形成中的作用提供支持。

文件详解

  • R语言数据文件(.rdata格式,共6个):
  • 16_Binom_fqcy_Div-Rel.Rdata、02_PreProcessing.Rdata等:存储不同分析阶段的处理结果与统计数据,如预处理数据、二项式分析结果等
  • 文档文件(.pdf格式,共2个):
  • Link to FigS2_CNV_along_CHR.pdf:染色体上CNV分布的补充图表
  • Res_CNV-NJ_PoolsAndLanes.pdf:CNV相关的邻接归并(NJ)分析结果图
  • 压缩文件(.rar格式,共1个):
  • RawCoverageCount_PicardCalculateHsMetrics.rar:原始覆盖度计数的压缩文件
  • 代码文件(.r格式,共1个):
  • RawAlphaMatrix_OptimalSegmentation.R:用于最优分割分析的R语言代码

适用场景

  • 分子生物学研究:分析基因拷贝数变异在豌豆蚜宿主适应中的功能作用
  • 进化生物学研究:探究CNV对物种形成及种群分化的影响机制
  • 昆虫学研究:研究化学感应基因(如味觉、嗅觉受体)的拷贝数变异与宿主选择的关系
  • 生物信息学分析:验证CNV检测算法在昆虫基因组数据中的应用效果
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 97.25 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。