数据集概述
本数据集聚焦鸣唱绿鹃（Vireo gilvus）的隐存种研究，包含其东部亚种（V. g. gilvus）与西部亚种（V. g. swainsoni）的线粒体及核DNA遗传分化数据，以及接触带杂交情况分析结果，用于验证两亚种是否为独立物种。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_Lovell_et_al_main_data_set.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，提供数据背景、使用方法等信息
- 数据文件
- 文件名称：HZARgenFreq.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Locality（地点）、distance（距离）、mtDNA（线粒体DNA）、HI（杂合度指数）及多个ACT_CAA系列遗传标记频率等字段
- 文件名称：Lovell_et_al_AFLP.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Accn No（编号）、Coll No（采集号）、Population（种群）、Pop No（种群编号）及多个ACT_CAA系列AFLP遗传标记字段
- 代码文件
- 文件名称：mleHelper.R、runHZAR.R、params.R、modelLoader.R、mcmcHelper.R
- 文件格式：R
- 字段映射介绍：用于遗传数据分析的辅助脚本，包含模型加载、参数设置、MCMC模拟等功能代码
数据来源
论文“Cryptic speciation in the Warbling Vireo (Vireo gilvus)”
适用场景
- 鸟类遗传学研究：分析鸣唱绿鹃不同亚种的遗传分化水平
- 隐存种鉴定：验证鸣唱绿鹃东部与西部亚种是否为独立物种
- 杂交带分析：研究加拿大阿尔伯塔中部接触带的物种杂交情况
- 生物信息学方法应用：利用提供的R脚本复现遗传数据分析流程
- 迁徙隔离机制研究：结合遗传数据探讨迁徙差异对生殖隔离的影响
