WASAP_Based_西非高粱遗传生理育种基因组资源数据

数据集概述

本数据集为西非高粱遗传、生理与育种研究的基因组资源,包含756份来自尼日尔、马里、塞内加尔和多哥的高粱种质资源(WASAP面板)的基因型与表型数据。通过测序获得159,101个高质量SNP标记,分析了遗传多样性、连锁不平衡及群体结构,并定位了开花时间和株高相关QTL,为西非高粱气候适应性品种育种提供基础。

文件详解

  • Supplemental_Data_S1.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:补充数据表,可能包含WASAP面板种质资源的基础信息、表型测定数据(如开花时间、株高)、群体结构分析结果或QTL定位相关的辅助数据。
  • WASAP_GBS_SNP_v3.1_maf01.vcf
  • 文件格式:VCF
  • 字段映射介绍:包含756份高粱种质的基因型数据,通过GBS技术生成的159,101个高质量双等位基因SNP标记,最小等位基因频率为0.01,记录每个位点的等位基因信息、基因型分布及质量控制指标。

适用场景

  • 高粱遗传多样性研究:分析西非高粱种质的遗传变异、群体结构及基因池分布特征。
  • 作物育种标记开发:利用SNP标记开展分子标记辅助选择,加速西非高粱气候适应性品种选育。
  • 表型性状遗传解析:基于开花时间、株高等表型数据与基因型的关联分析,挖掘关键调控基因。
  • 比较基因组学研究:对比西非与全球高粱种质的遗传差异,解析区域适应性相关的分子机制。
  • 种质资源利用:为西非国家育种项目提供多样化的高粱遗传资源信息,支持种质创新与品种改良。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 465.53 MiB
最后更新 2026年2月7日
创建于 2026年1月30日
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