数据集概述
本数据集通过2b-RAD测序技术,分析了大湄公河次区域(GMS)白背飞虱(WBPH)迁入中国北方的种群遗传结构。包含18个山东站点及6个GMS区域的样本基因数据,揭示了迁入来源、遗传多样性及种群聚类特征,为明确白背飞虱迁移路线及来源提供支撑。
文件详解
- 基因测序结果文件
- 文件名称:result_vcf.vcf、SNP.final.recode.vcf
- 文件格式:VCF
- 字段映射介绍:包含白背飞虱样本的单核苷酸多态性(SNP)标记信息,记录基因位点、等位基因及样本基因型数据
- 种群遗传分析文件
- 文件名称:wgenepop.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:标题含"wbph"及编号序列,记录种群遗传分析的基础数据,用于种群结构及迁移分析
- 遗传数据分析文件
- 文件名称:WBPH_Genalex.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:用于Genalex软件的遗传数据分析表格,包含样本遗传标记及种群分类信息
数据来源
论文“Immigration of Sogatella furcifera from the Greater Mekong Subregion into northern China revealed by 2b-RAD sequencing”
适用场景
- 农业病虫害监测: 分析白背飞虱从GMS迁入中国北方的种群来源及迁移路径,支撑病虫害预警
- 种群遗传学研究: 基于SNP标记数据,研究白背飞虱种群遗传多样性、遗传结构及聚类特征
- 生物入侵机制分析: 探究地理隔离与迁移对种群遗传结构的影响机制
- 农业防控策略制定: 为白背飞虱跨区域迁移的防控措施提供基因层面的科学依据