数据集概述
本数据集聚焦加拿大北方森林中蚯蚓入侵与无蚯蚓土壤的微生物群落组成,通过磷脂脂肪酸(PLFA)分析及16S rRNA基因(细菌和古菌)、ITS2区域(真菌)的 metabarcoding 技术,探究蚯蚓入侵对土壤理化性质及微生物群落的影响。数据包含2019年夏季采集的矿质土壤、森林地被物和蚯蚓粪便样本的相关分析结果,共5个文件。
文件详解
- README.md:MD格式,包含数据集标题、样本采集信息(2019年夏季加拿大北方森林多个站点的矿质土壤、森林地被物、蚯蚓粪便样本)、PLFA提取方法(改良Bligh和Dyer法)及PLFA鉴定工具(Sherlock Microbial Identification System)等说明。
- PLFA_dataset_1.xlsx:XLSX格式,蚯蚓入侵与无蚯蚓土壤的磷脂脂肪酸分析数据集1。
- PLFA_dataset_2.xlsx:XLSX格式,蚯蚓入侵与无蚯蚓土壤的磷脂脂肪酸分析数据集2。
- ITS-ASV_table.xlsx:XLSX格式,真菌ITS2区域扩增子序列变体(ASV)表格数据。
- 16S-ASV_table.xlsx:XLSX格式,细菌和古菌16S rRNA基因扩增子序列变体(ASV)表格数据。
数据来源
标题为“Microbial community composition of earthworm-invaded and earthworm-free soils of the Canadian boreal forest”的研究
适用场景
- 土壤微生物生态学研究:分析蚯蚓入侵对加拿大北方森林土壤细菌、古菌和真菌群落组成的影响。
- 蚯蚓入侵生态效应评估:探究蚯蚓活动通过改变土壤理化性质对微生物群落的调控机制。
- 森林土壤健康监测:利用PLFA和 metabarcoding 数据评估蚯蚓入侵对土壤生态系统功能的影响。
- 微生物多样性分析:基于ASV表格数据开展土壤微生物多样性、群落结构及物种丰度的比较研究。