Wellcome_Open_Research_布氏锥虫蛋白质组低复杂度区域识别基础数据2020

数据集概述

本数据集是布氏锥虫蛋白质组低复杂度区域(LCRs)识别的基础数据,包含6个补充文件,涉及InterPro结构域与LCR的位置信息、基因本体富集分析、序列特性分析、翻译后修饰(PTMs)分布及信号肽与LCR的重叠情况等内容,为布氏锥虫蛋白质组功能研究提供结构化参考。

文件详解

  • Supplement File 2.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含每个InterPro结构域和LCR的位置信息,所有基因的染色体定位、跨膜结构域存在情况、信号肽信息,以及蛋白质定位(DeepLoc预测或Tryptag观测结果)。
  • Supplement File 3.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含基因列表,以及N端、中部、C端或组合区域含预测LCR的蛋白质的分子功能基因本体(GO)富集分析结果。
  • Supplement File 4.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含每个已识别的InterPro结构域和LCR的序列特性分析数据。
  • Supplement File 5.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含基因列表,以及极性指数低(9)的蛋白质的分子功能GO富集分析结果。
  • Supplement File 6.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含InterPro结构域和LCR上的翻译后修饰(PTMs)列表及位置,PTMs来源数据集(Zhang2020等8个数据集),修饰所在结构域/LCR的序列特性;第二工作表包含Ooi2020中LCR上的修饰列表。
  • Supplement File 7.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含LCR和信号肽的列表及位置,以及两者的重叠情况。

数据来源

Wellcome Open Research论文“Cayla et al., 2020”

适用场景

  • 布氏锥虫蛋白质组结构分析:研究LCR与InterPro结构域的位置关系及蛋白质亚细胞定位特征。
  • 蛋白质功能注释:通过GO富集分析探索含LCR蛋白质的分子功能及极性指数对功能的影响。
  • 翻译后修饰研究:分析布氏锥虫蛋白质组中PTMs在LCR和结构域上的分布规律。
  • 蛋白质序列特性研究:探究LCR的序列特性及其与信号肽的重叠对蛋白质功能的潜在影响。
  • 寄生虫分子生物学研究:为布氏锥虫的基因功能、蛋白质调控机制等研究提供基础数据支持。
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 13.39 MiB
最后更新 2026年1月12日
创建于 2026年1月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。