数据集概述
本数据集聚焦西高止山脉特有鸟类物种复合体,通过14个微卫星标记对218个个体的基因数据,分析自然与人为斑块间的历史及当代基因流。揭示深谷的遗传结构屏障作用,对比自然斑块与人为碎片的遗传分化差异,为识别近期栖息地破碎化提供依据。
文件详解
- README文档
- 文件名称:
README_for_mmod.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、文件结构及使用方法
- 基因分型数据
- 文件名称:
genotyping_all_Shortwing_data_genepop.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:218个个体的14个微卫星基因分型数据,采用Genepop格式
- 基因流分析数据
- 文件名称:
mmod.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于mmod分析的基因流数据文件
- 种群结构分析数据
- 文件名称:
Structure TESS BIMR.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含Structure、TESS、BIMR等种群结构分析的相关数据
- 系统发育树结果
- 文件名称:
poptree results.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含poptree分析生成的系统发育树结果数据
数据来源
论文“Islands within islands: two montane paleo-endemic birds impacted by recent anthropogenic fragmentation”
适用场景
- 生物多样性保护: 分析山地特有鸟类对人为栖息地破碎化的响应,为保护策略制定提供依据
- 种群遗传学研究: 利用微卫星数据探讨历史与当代基因流模式,揭示种群分化机制
- 景观遗传学分析: 结合地理屏障(如深谷)研究遗传结构与栖息地斑块化的关系
- 保护遗传学应用: 通过DPS/FST比值识别近期栖息地破碎化事件,评估物种受威胁程度
- 进化生物学研究: 探讨山地特有物种对自然与人为双重斑块化环境的适应进化过程