数据集概述
本数据集为论文“WIND (Workflow for pIRNAs aNd beyonD): a strategy for in-depth analysis of small RNA-seq data”的补充表格压缩包，包含5个补充表格，涵盖人类和小鼠基因组GFT文件统计、spike-in定量结果、小鼠心肌细胞sncRNA分析统计、GSE68246数据集差异表达分子及BRCA TCGA数据集差异表达分子（含piRNA靶标预测）等内容。
文件详解
- 文件名称：
Supplementary Tables.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含5个补充表格，具体内容为：
- Supplementary Table 1：人类和小鼠基因组GFT文件过滤过程及最终GTF数据统计
- Supplementary Table 2：各样本不同定量方法下piRNA样分子占原始reads的百分比
- Supplementary Table 3：小鼠心肌细胞sncRNA分析结果（两种方法）及top100表达piRNA列表
- Supplementary Table 4：GSE68246数据集差异表达分子（含与Boo et al.共同DE的miRNA、上下调分子及校正p值<0.05的分子标记）
- Supplementary Table 5：BRCA TCGA数据集差异表达分子（含上下调标记、校正p值<0.05标记及DE piRNA的靶标RNA预测）
数据来源
论文“WIND (Workflow for pIRNAs aNd beyonD): a strategy for in-depth analysis of small RNA-seq data”
适用场景
- 小RNA测序数据分析方法验证：用于评估WIND工作流程在piRNA及其他sncRNA分析中的性能与结果可靠性
- 基因组注释数据统计分析：基于人类和小鼠基因组GFT/GTF文件统计结果，研究基因组注释数据的特征
- 差异表达分子研究：分析GSE68246和BRCA TCGA数据集中小RNA的差异表达模式及其生物学意义
- piRNA靶标预测验证：利用BRCA TCGA数据集的piRNA靶标预测结果，探索piRNA的调控机制
- 测序数据定量方法比较：通过spike-in定量结果，比较不同方法在piRNA样分子定量中的准确性
