数据集概述
本数据集为论文“Within-host stochastic dynamics of immune-escape mutants”配套的模拟数据,包含宿主内免疫逃逸突变体随机出现动力学的模拟代码及说明文件。数据用于研究急性感染中更适应的突变株从自限性菌株突变后的出现概率,分析免疫细胞增殖对突变株出现的影响及不同突变类型(增长速率提升、免疫耐受)的演化优势。
文件详解
- README_for_HartfieldAlizon2015_WithinHost_SimCode.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含模拟文件的说明文档,说明该文件是论文所用出现模拟的源代码,模拟代码基于C语言编写,需编译后执行,依赖GNU科学库(GSL),并提示参考各程序开头的描述了解执行方法。
- HartfieldAlizon2015_WithinHost_SimCode.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含宿主内免疫逃逸突变体随机出现动力学的模拟源代码,用于复现论文中的模拟实验,分析免疫细胞增殖对突变株出现概率的影响及不同突变类型的演化优势。
数据来源
论文“Within-host stochastic dynamics of immune-escape mutants”
适用场景
- 进化流行病学研究: 分析宿主内免疫逃逸突变体的随机出现概率及动力学机制。
- 免疫-病原体相互作用模拟: 复现并扩展宿主内免疫细胞增殖对突变株出现的抑制效应研究。
- 病原体演化策略比较: 对比增长速率提升型与免疫耐受型突变株的短期演化优势差异。
- 人类病原体宿主内演化分析: 为HIV、丙型肝炎病毒及癌症等人类病原体的宿主内演化动力学研究提供模型参考。