数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了LX533菌株(rgs-6(vs62)X)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2011年9月15日在英国MRC分子生物学实验室完成,使用tierpsy软件追踪线虫行为,包含视频转换文件、特征数据文件及实验元数据,共3个文件。
文件详解
- 行为轨迹数据文件:
rgs-6 (vs62)X on food R_2011_09_15__11_40_06___6___2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为轨迹的核心数据,包含视频帧对应的线虫骨架分割信息(共26685个分割骨架)、空间坐标及时间序列数据
- 行为特征数据文件:
rgs-6 (vs62)X on food R_2011_09_15__11_40_06___6___2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储由tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,涵盖运动速度、身体弯曲度、头部摆动频率等量化特征
- 视频转换压缩文件:
rgs-6 (vs62)X on food R_2011_09_15__11_40_06___6___2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含视频转换后的行为数据压缩包,可能存储标准化的线虫行为轨迹格式(wcon)数据
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析rgs-6基因对秀丽隐杆线虫运动行为的调控作用
- 行为学实验方法验证:基于标准化实验流程(E. Yemini et al. 方法)验证线虫行为追踪技术的可靠性
- 神经生物学机制分析:通过行为特征数据探究rgs-6基因相关的神经信号通路对运动的影响
- 模式生物行为数据库补充:作为公开线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为学数据的整合分析